BTN60904 一站式RNA電泳套裝

產品簡介
一站式RNA電泳套裝由北京百奧萊博供貨并提供相關技術服務支持,本品用于科研目的,本品質量穩定,價位合理,需要一站式RNA電泳套裝等核酸電泳和回收產品的客戶,請到我公司官網聯系我們。...
產品詳細介紹
特別提示:包括一站式RNA電泳套裝在內,本公司的所有產品僅可用于科研實驗,嚴禁用于臨床醫療及其他非科研用途!
產品名稱:一站式RNA電泳套裝
英文名稱:One-Stop RNA Electrophoresis Pack
產品貨號:BTN60904
產品規格:10次
本品是包括瓊脂糖、去離子甲醛、RNA上樣液、電泳液等在內的RNA電泳套裝,專門用于RNA電泳分析。可以進行至少10次mini變性膠電泳。
產品特點:
1. 即開即用,用戶不需要自己進行RNase 滅活、高壓滅菌、pH調節等操作。
2.與Northern雜交等后續反應兼容。
產品組成:
| 成分 | 規格 |
| 瓊脂糖 | 5g |
| 超純水 | 250ml |
| 甲醛 | 60ml |
| RNAload(含EB) | 0.5ml |
| RNAep,10× | 100ml |
| 說明書 | 1份 |
儲存條件:常溫運輸和保存,但收到貨后RNAload 需要4℃保存,RNAep,10×一旦打開需要-20℃保存,有效期一年。
使用方法:
注意:所有器皿(三角瓶,電泳槽,槍頭等)均需去除RNase。強烈推薦使用本公司的的固相RNase 清除劑。
一、配制瓊脂糖甲醛變性膠(1.2%,100mL)
1.在三角瓶中加入下列成份:瓊脂糖 1.2-1.5g;DEPC水 87mL
2. 將瓊脂糖加熱融化后,加入10mL 10×RNAep(10×RNAep 就是10×MOPS緩沖液,其瓶子一旦打開,就很容易產生污染細菌,細菌大量繁殖后會釋放大量 RNase,所以剩下的10×RNAep zuì好-20℃放置)。
3. 待膠冷卻至 60℃左右,再加下列成份:甲醛 3.0mL;自備EB(10mg/mL)2-4μL
注意:由于本試劑盒提供的RNAload中含EB,所以也可以不加EB,但效果較差。如果使用自備的其他染料,如SYBR Green I,則不能同時使用其他染料,包括含EB的RNAload,用戶需要另購不含EB的RNAload)。
4. 混勻后倒膠,凝固半小時后即可以使用。
二、配制電泳液
5. 將RNAep 用DEPC 水稀釋十倍后即成電泳液,所需要的體積根據使用的電泳槽決定。
三、變性RNA樣品
6.在一干凈的離心管中將5-10μL RNA和15μL RNAload 混合,50-60℃保溫10分鐘后冰浴5-10分鐘,直接上樣。注意:每一泳道至多可分析30μg RNA,通常用10-20μg 總RNA進行Northern雜交,可以檢測高豐度mRNA(占mRNA 總量的0.1%以上);如待測RNA含量微,每個泳道需加0.5-3.0μg poly(A)+ RNA。
四、電泳
7.電泳時,將凝膠預電泳5 min(電壓為5 V/cm)。隨后加樣品和分子量對照(如果有的話),以3-4 V/cm的電壓電泳,直至染料遷移至膠下游的3/4處。
8.電泳結束后,在300nm 紫外燈下拍照。
五、后續處理
9. 按標準方法進行Northern雜交等后續處理。
使用效果:

圖注: 用本產品電泳兔全血總RNA效果圖。10μL 總RNA與15μL RNAload 混合后在甲醛瓊脂糖變性膠上電泳0.5小時,直接在紫外燈下觀察并照相。
疑難解答:
Q:RNA電泳為何zuì好使用RNAep,不要使用DNA電泳液TAE或TBE?
A:一是因為RNAep 經過去RNase處理,而一般實驗室使用的TAE或TBE都沒有經過去RNase處理,故有可能含RNase,使樣品RNA 降解。即使要滅活TAE或TBE中的RNase 也十分麻煩,因為DEPC 不能處理含Tirs的緩沖液;二是TEB含有硼酸,硼酸是研究多羥基醇和糖的經典試劑,它能與RNA中含多羥基的核糖反應生成糖硼酸絡合物,故電泳時RNA 帶型十分彌散。在一定濃度范圍內,RNA分子間還能通過硼酸形成分子間復合物,出現電泳時各種RNA以一條帶的形式出現的現象。所以RNA電泳時要避免使用含硼酸的緩沖液。使用TAE效果雖然比TBE 稍好,但文獻報道(BioTechniques 2000,28:414-415),它不能分離某些大小不同的RNA分子。
Q:上樣孔里的紅色熒光物一定是污染的基因組DNA 嗎?
A:不是。用TAE或TBE電泳液和非變性膠電泳RNA時容易產生此現象,初步研究發現大部分紅色熒光物是變性不充分的單鏈RNA通過堿基互補或通過硼酸絡合(如果使用TBE作電泳液的話)形成的復合物,加RNase處理后,這些紅色熒光物一般會消失。為避免此現象,建議zuì好使用甲醛變性膠電泳。如果需要使用非變性膠,也必須在上樣前使RNA變性。
使用百奧萊博優化的上樣/變性/染色三用溶液RNAload可以使RNA在非變性膠上電泳時也有較好分辨率。使用非變性膠時,可以使用TAE或超快電泳液SuperBuffer-2,zuì好不要使用TBE緩沖液,因為TBE中的硼酸能與RNA的多羥基形成復合物,RNA 很難形成銳利的條帶。
Q:如何確認和去處除污染的基因組DNA?
A:如果懷疑有DNA污染,可以用RNase處理RNA樣品,然后再電泳。如果上樣孔里的紅色熒光物不消失,則表示是基因組DNA污染。進一步確認可以使用PCR擴增法。去除污染的DNA可以使用非酶的DNA去除劑DNAScavenger或RNase-free DNase,由于RNase-free DNase一般都有殘留的RNase污染,所以必須嚴格按照廠家提供的使用手冊進行操作。
Q:為何我的植物RNA樣品有4-5 條帶?
A:部分植物組織有葉綠體等質體,而葉綠體有核糖體,所以也有其rRNA。
葉綠體的rRNA跟細胞漿里面核糖體的rRNA大小不同,所以一般會多出兩條帶(共4 條rRNA 條帶)。小的tRNA和5S rRNA 有時可見,有時不可見,取決于回收效率。
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名稱:一站式DNA尿素-PAGE電泳套裝
貨號:BTN90317
規格:30次
本品是專門用于DNA 尿素-PAGE電泳的一站式試劑盒。
產品特點:
1.一站式,即開即用,用戶不需單獨準備各種成分,十分方便。用戶不需要單獨準備各種成分。
2.可用于DNA 測序、AFLP、DDRT、TGGE和RNase 保護實驗等。
3. 安全,免去了實驗人員接觸粉末狀的劇毒物品丙烯酰胺。
4.電泳后可直接用于銀染、EB染色等實驗。
產品組成:
| 成分 | 規格 | 保存 |
| 電泳級尿素 | 210g | 常溫 |
| 電泳級丙烯酰胺 | 77.34g | 常溫 |
| 電泳級甲叉雙丙烯酰胺 | 2.67g | 常溫 |
| 10×TBE電泳液 | 250ml | 常溫 |
| 電泳級TEMED | 1.5ml | 4℃,避光 |
| 電泳級過硫酸銨 | 1g | 常溫 |
| 2×尿素-PAGE上樣液 | 1ml | -20℃ |
| 說明書 | 1份 |
儲存條件:常溫運輸,保存條件見上表,有效期一年。
使用方法:
一、PAGE濃度和交聯度的選擇指南
尿素-PAGE一般推薦用29:1(丙烯酰胺:甲叉雙丙烯酰胺)的交聯度,
在此條件下,DNA片段和zuì適PAGE濃度對應關系如下:
| 單鏈DNA長度 | zuì佳PAGE濃度 |
二甲苯青FF遷移率 對應的長度 |
溴酚藍的遷移率 對應的長度 |
| 50-400nt | 8% | 160nt | 45nt |
| 200-1000nt | 5% | 260nt | 65nt |
| 750-2000nt | 3.5% | 460nt | 100nt |
二、制備尿素-PAGE膠
1. 配制尿素-PAGE膠(這是配制100mL膠的用量,配制更大體積的膠則需以此用量為基礎按比例增加)
A:新鮮配制10%的APS(過硫酸銨):按每0.1 克過硫酸銨干粉加1mL超純水的比例將水加到裝有硫酸銨干粉的1.5mL EP 管中,搖晃到粉末全部溶解。配制好的10%的APS溶液可以在4℃存放一周。
B:新鮮交聯度為29:1的40%的丙烯酰胺-甲叉雙丙烯酰胺溶液(AB溶液,下同):在裝有77.34 g電泳級丙烯酰胺干粉的瓶中加入約120mL自備的去離子水,然后將全部甲叉雙丙烯酰胺加入到同一塑料瓶中(可以加少量丙烯酰胺溶液沖洗出來以避免粉末有毒粉末飄出。甲叉雙丙烯酰胺溶解度低,不會溶解在這少量溶液中)。充分搖晃混勻后所得溶液即40%的AB溶液。配制40%而非30%的原因是這樣可以在下步留出足夠空間加尿素。
C:配尿素-PAGE膠:在一個250mL的三角瓶中,先按下表的用量加入去離子水、40%AB溶液和10×TBE緩沖液。丙烯酰胺單體溶液具有神經毒性,一定要戴手套操作。
| PAGE膠濃度 | 各成分用量(尿素為克,其余單位是mL) | 補水到(mL) | ||
| 尿素 | 40%AB溶液 | 10×TBE緩沖液 | ||
| 5% | 42 | 12.5 | 5.0 | 100 |
| 6% | 42 | 15.0 | 5.0 | 100 |
| 7% | 42 | 17.5 | 5.0 | 100 |
| 8% | 42 | 20.0 | 5.0 | 100 |
| 9% | 42 | 22.5 | 5.0 | 100 |
| 10% | 42 | 25.0 | 5.0 | 100 |
| 11% | 42 | 27.5 | 5.0 | 100 |
| 12% | 42 | 30.0 | 5.0 | 100 |
D:攪拌溶解,然后用濾紙過濾。zuì好能抽真空10-15分鐘以去除溶液中的氧氣(氧氣能抑制丙烯酰胺聚合反應),無條件也可以不脫氧。
E:加入500μL 10%APS和100μL TEMED,迅速搖勻后倒膠。
F:在膠的液面距離達到頂部時停止灌膠,插入梳子。
G:室溫聚合30-60分鐘(低溫抑制聚合反應)。
H: 拔出梳子,用0.5×TEB液沖洗加樣孔。
三、樣品準備
2. 對一般樣品、測序樣品、微衛星DNA、AFLP樣品、DDRT樣品、RPA樣品:將樣品跟上樣液1:1 混合,95℃ 3分鐘變性,然后放冰上待用。
3. 對TGGE樣品:可以直接上樣。
四:電泳
4. 將凝膠板固定在電泳裝置上,往上槽和下槽中加入足夠0.5×TEB電泳液。
5.預電泳5-30分鐘將冰上放置的樣品上樣。
6.連接電源線,打開電源開關。根據膠的大小選擇功率(固定功率可以固定產熱,這樣不容易發生過熱而使膠板破裂的現象。如果固定電流或電壓,產熱都將隨電泳時間而變化,不好控制)。對小膠一般用5-6W 固定功率,大膠用15-25W 固定功率。
7. 終止電泳,取出凝膠進行后續的處理(如銀染)。注意:如果銀染,必須延長固定時間以便讓洗出尿素,否則殘留尿素會干擾后面的銀染。

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| RFT012 | 15kb plus DNA ladder(250~15000bp) | 100T(2×250μl) |
| RFT013 | 2kb DNA ladder(100~2000bp) | 100T(2×250μl) |
| SY0249 | 溴化乙錠 | 1g |
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