WH0065 總RNA提取試劑

產(chǎn)品簡介
總RNA提取試劑由專業(yè)試劑供應(yīng)商北京百奧萊博提供,用于科研目的,我公司的總RNA提取試劑品質(zhì)上佳,經(jīng)過多年的開發(fā)生產(chǎn),已然非常成熟,歡迎廣大新老客戶訂購。...
產(chǎn)品詳細(xì)介紹
特別提示:包括總RNA提取試劑在內(nèi),本公司的所有產(chǎn)品僅可用于科研實驗,嚴(yán)禁用于臨床醫(yī)療及其他非科研用途!
產(chǎn)品名稱:總RNA提取試劑
英文名稱:Total RNA Extraction Reagent
產(chǎn)品貨號:WH0065
產(chǎn)品規(guī)格:100ml
本制品是基于異硫氰酸胍/苯酚法的一種即用的從細(xì)胞和組織中提取總RNA的試劑,在樣品裂解或勻漿過程中,本制品可保持RNA完整性,同時裂解細(xì)胞,溶解細(xì)胞內(nèi)含物。加入氯fǎng后,溶液分為水相、中間層和有機相,RNA在水相中。取出水相,用異丙醇可沉淀回收RNA;中間層用乙醇沉淀可回收DNA;有機相用異丙醇沉淀可回收蛋白。本制品可用于小量樣品(50-100mg組織、5×1067
產(chǎn)品特點:
·本制品為黃顏色,便于區(qū)分水相和有機相,方便使用。
· RNA純度高:可有效去除DNA殘留、有機溶劑污染和蛋白雜質(zhì)。
· RNA得率高,可用于多種下游實驗。
儲存條件:2-8℃避光保存12個月。
自備試劑:氯fǎng、異丙醇、RNase-free ddH2O、75%乙醇(用RNase-free ddH2O配制)。
預(yù)防RNase污染,應(yīng)注意以下幾方面:
1.經(jīng)常更換新手套。因為皮膚經(jīng)常帶有細(xì)菌,可能導(dǎo)致RNase污染。
2.使用無RNase的塑料制品和槍頭避免交叉污染。
3.RNA在裂解液RL中時不會被RNase降解。但提取后繼續(xù)處理過程中應(yīng)使用不含RNase的塑料和玻璃器皿。玻璃器皿可在150℃烘烤4 h,塑料器皿可在0.5M NaOH中浸泡10min,然后用水徹底清洗,再滅菌,即可去除RNase。
4.配制溶液應(yīng)使用無RNase的水。(將水加入到干凈的玻璃瓶中,加入DEPC至終濃度0.1%(V/V),放置過夜,高壓滅菌。)
使用前注意事項:
1.勻漿后,加氯fǎng前,樣品可在-70℃放置一個月以上;
2.RNA沉淀可以保存在75%酒精中,2-8℃一個星期以上或-20℃一年。
操作步驟:
1.勻漿處理
a.植物組織:以葉片RNA提取為例。取新鮮葉片在液氮中充分研磨或?qū)⑷~片剪碎后直接在本制品中研磨,研磨要迅速,zuì好不要超過1 min。大約100mg葉片使用1ml本制品。
b.動物組織:以鼠肝臟RNA提取為例。取新鮮或-70℃凍存組織,每30-50 mg組織加入1ml本制品,用勻漿儀進行勻漿處理。樣品體積一般不要超過本制品體積的10%。
c.單層培養(yǎng)細(xì)胞:單層貼壁細(xì)胞的收集(收集細(xì)胞數(shù)量請不要超過1×107 1)直接裂解法:直接在培養(yǎng)板中加入本制品裂解細(xì)胞,每10cm2面積加入1ml本制品。用取樣器吹打幾次。注意:本制品加量根據(jù)培養(yǎng)板面積決定,不是由細(xì)胞數(shù)決定。如果本制品加量不足,可能導(dǎo)致提取的RNA中有DNA污染。
2)胰蛋白酶處理法:確定細(xì)胞數(shù)量,吸除培養(yǎng)基,用PBS洗滌細(xì)胞,吸除PBS,向細(xì)胞中加入含有0.1-0.25%胰蛋白酶的PBS處理細(xì)胞,當(dāng)細(xì)胞脫離容器壁時,加入含有血清的培養(yǎng)基失活胰蛋白酶,將細(xì)胞溶液轉(zhuǎn)移至RNase-Free的離心管中,300×g離心5 min,收集細(xì)胞沉淀,仔細(xì)吸除所有上清。
注意:收集細(xì)胞時一定要將細(xì)胞培養(yǎng)液去除干凈,否則會導(dǎo)致裂解不完全,造成RNA的產(chǎn)量降低。
d.細(xì)胞懸液:離心取細(xì)胞。每5×106-107動物、植物和酵母細(xì)胞或每107細(xì)菌細(xì)胞加入1ml本制品。加入本制品前不要洗滌細(xì)胞,以免降解mRNA。一些酵母和細(xì)菌細(xì)胞可能需要勻漿儀處理。
e.血液處理:直接取新鮮的血液,加入3倍體積本制品(推薦0.25 ml全血加入0.75 ml本制品),充分振蕩混勻。
2.將勻漿樣品在15-30℃放置5 min,使得核酸蛋白復(fù)合物完全分離。
3.可選步驟:4℃ 12000rpm(~13400×g)離心10min,取上清。
注意:如果樣品中含有較多蛋白、脂肪、多糖或肌肉、植物結(jié)節(jié)部分等,可離心去除。離心得到的沉淀中包括細(xì)胞外膜、多糖、高分子量DNA,上清中含有RNA。處理脂肪組織樣品時,上層是大量油脂,應(yīng)除去。取澄清的勻漿溶液進行下一步操作。
4.每使用1ml本制品加入0.2 ml氯fǎng,蓋好管蓋,劇烈振蕩15 sec,室溫放置3 min。
注意:如不能旋渦混勻,可手動顛倒混勻2 min代替。
5.4℃ 12000rpm(~13400×g)離心10-15 min,樣品會分成三層:黃色的有機相,中間層和上層無色的水相,RNA主要在水相中,把水相(約600μl)轉(zhuǎn)移到新的離心管中。(如要分離DNA和蛋白質(zhì),可向我公司索取提取方法)。
6.在得到的水相溶液中加入等體積異丙醇,混勻,室溫放置20-30 min。
7.4℃ 12000rpm(~13400×g)離心10min,去上清。離心前RNA沉淀經(jīng)常是看不見的,離心后在管側(cè)和管底形成膠狀沉淀。
8.加入1ml 75%乙醇(RNase-Free ddH2O配置)洗滌沉淀。每使用1ml本制品至少用1ml75%乙醇對沉淀進行洗滌。
9.4℃ 5000rpm(~2,300×g)離心3 min。倒出液體,注意不要倒出沉淀,剩余的少量液體短暫離心,然后用槍頭吸出,注意不要吸到沉淀。
10.室溫放置晾干(不要晾的過干,RNA完全干燥后會很難溶解,大約晾干2-3 min左右即可),根據(jù)實驗需要,加入30-100 μl RNase-Free ddH2O,反復(fù)吹打、混勻,充分溶解RNA。
不同組織或細(xì)胞RNA提取預(yù)期得率:
植物葉片:100~200μg/g葉片
動物組織:6~10μg/mg肝臟組織
動植物培養(yǎng)細(xì)胞:5~10μg/106細(xì)胞
大腸桿菌:2~10μg/ml DH5α過夜菌
血液:3~5μg/ml人類全血
常見問題分析:
低得率:
A.樣品裂解或勻漿處理不徹底。
B.zuì后得到的RNA沉淀未完全溶解。
A260/A280<1.65:
A.檢測吸光度時,RNA樣品不是溶于TE,而是溶于水。低離子濃度和低pH條件下,A280值會較高。
B.樣品勻漿時加的試劑量太少。
C.勻漿后樣品未在室溫放置5 min。
D.水相中混有有機相。
E.zuì后得到的RNA沉淀未完全溶解。
RNA降解:
A.組織取出后沒有馬上處理或冷凍。
B.樣品或提取的RNA沉淀保存于-5℃- -20℃,未在-60℃- -70℃保存。
C.細(xì)胞在胰蛋白酶處理時被破壞。
D.溶液或離心管未經(jīng)RNase去除處理。
E.電泳時使用的甲酰胺pH低于3.5。
DNA污染:
A.樣品勻漿時加的試劑體積太少。
B.樣品中含有組織溶劑(如乙醇,DMSO等),強緩沖液或堿性溶液。
蛋白和多糖污染:
A.樣品中蛋白、多糖含量高。
B.樣品量太大。
C.水相中混有有機相。
根據(jù)您的關(guān)注的總RNA提取試劑,您可能還對以下產(chǎn)品有需求:
名稱:細(xì)菌RNA提取試劑盒
貨號:BTN51102
規(guī)格:100次
本試劑盒是在動物RNA提取試劑盒基礎(chǔ)上根據(jù)細(xì)菌提取的具體情況改良而得。它基于異硫氰酸胍/酚/氯fǎng提取RNA原理,可用于包括E.coli、Campylobacter fetus、Pseudomo
試劑盒特點:
1. 操作簡單快速,只要十分鐘左右,可以全在室溫下進行。
2. 所得 RNA 質(zhì)量高,OD260/OD280一般在 1.9,不含基因 DNA污染。
3. 靈敏度高,可以從一個菌落中提取到普通電泳能夠檢測到的總 RNA。
4. 高于進口同類產(chǎn)品。
試劑盒組成:
| 成分 | 規(guī)格 |
| 細(xì)菌RNA提取試劑 | 100ml |
| 說明書 | 1份 |
儲存條件:常溫運輸,4℃保存,有效期一年。
使用方法:
1.在 1.5mL塑料離心管中離心收集0.2-1.5mL 新鮮細(xì)菌(注意:由于細(xì)菌RNA 半衰期十分短,所以,必須使用zuì新鮮細(xì)菌),吸盡液體培養(yǎng)基,加入1mL細(xì)菌RNA提取試劑盒并用槍充分吹打,確保細(xì)菌全部裂解,沒有塊狀物。
如果使用菌落,則用接種環(huán)小心將其轉(zhuǎn)移到裝有1mL細(xì)菌RNA提取試劑盒的1.5 m塑料離心管中,用移液槍吹打均勻。在細(xì)菌數(shù)較少時,建議使 用助沉劑 RNApp以提高 RNA 回收率。
2. 加入0.2mL 氯fǎng,在振蕩器上充分振蕩混均 30秒(必須將管底的液體振蕩起來,否則不能有效將DNA 打斷和去除蛋白質(zhì))。
3. 12000~15000g室溫離心3分鐘。上清液無色,下層液呈籃色,中間為蛋白質(zhì)。小心將上清液轉(zhuǎn)移到另一干凈 1.5ml塑料離心管中,上清液體積約為0.6mL。為避免觸及中間層的DNA和蛋白質(zhì),建議分小量多次 吸取,并且只取 0.5mL,留 0.1mL左右。當(dāng)細(xì)菌數(shù)量較少時,中間層十分松散,上清時很容易吸到下層有機相,需要更加小心。
4.在上清液中加入等體積的異丙醇,振蕩器上振蕩混均 30秒。
5. 12000~15000室溫離心 3-10分鐘,RNA 將在管底側(cè)面形成沉淀。
6.小心吸棄上清液,注意不要吸棄 RNA沉淀。
7.在離心管中加入1mL 75%乙醇,振蕩器上振蕩混均 30秒。
8. 12000~15000g室溫離心 1分鐘。
9.小心吸棄上清液,注意不要吸棄 RNA沉淀。
10. 重復(fù)第 8 到第 10 步一次。
11. 短暫快速離心,用移液槍小心吸棄殘留液(約50μl)。
12. 短暫放 1-2分鐘后加入適量 RNA 溶解液使 RNA沉淀溶解,可以立即使用或存放于-80℃長期保存。
13. RNA 完整性的電泳檢測:
如果需要做 Northern雜交,強烈建議用戶使用甲醛變性膠進行RNA電泳,因為非變性膠不能分離所有的RNA分子(BioTechniques,28:414,2000)。如果是簡單檢測,可以使用TAE或百奧萊博的SuperBuffer-2 DNA/RNA 兩用快速電泳液,但文獻報道必須使用變性上樣液(BioTechniques,9:558,1990)。普通 DNA上樣液不含變性劑,也沒經(jīng)過去 RNase處理,所以zuì好不要使用。 尤其需要注意的是不要使用TBE進行RNA電泳,因為TBE 所含硼酸是研究多糖的經(jīng)典方法----硼酸絡(luò)合法中的關(guān)鍵成分,硼酸通過與RNA 核糖中的羥基發(fā)生絡(luò)合反應(yīng),形成RNA分子內(nèi)或RNA分子間的絡(luò)合復(fù)合物,使同樣長度的RNA 具有不同的泳動速度,電泳條帶彌散,同時有大的RNA 絡(luò)合復(fù)合物遲留在加樣孔中(一般會誤以為是基因組DNA污染)。RNA分子內(nèi)或RNA分子間的絡(luò)合物的形成的多少和比例又與硼酸與RNA的數(shù)量比例有關(guān),而RNA樣品中污染的其他多糖(如植物中提取的RNA)也會參與此反應(yīng),使硼酸對RNA電泳的影響更復(fù)雜,所以TBE 對RNA電泳的影響沒有規(guī)律性和重復(fù)性。有的樣品可以使用有的又不行,zuì好是避免使用。
由于細(xì)菌細(xì)胞中70-80%的RNA為rRNA,后者又由23S(約3700nt),16S(約1700nt)和5S(約100nt)三種組成,所以變性膠電泳后應(yīng)該在UV下看見三條清晰的rRNA帶。由于核酸長度與結(jié)合 EB的數(shù)量成正比(當(dāng)然還與RNA的二級結(jié)構(gòu)有關(guān),雙鏈部分結(jié)合能力比單鏈部分強),所以23S rRNA條帶的熒光強度一般比16S rRNA條帶的熒光強度強2倍。如果這兩條rRNA 帶不清晰或比例小于此范圍則表示 RNA 有降解(因為大的RNA 被酶降解的可能更大)。
14. RNA產(chǎn)量產(chǎn)率測定:
將5-10μl RNA 溶于TE緩沖液中(pH7.5-8.2 之間)檢測其在OD260的光吸收。通過光吸收可以得出 RNA濃度(1 OD260的RNA=40μg/mL),進而計算出 RNA的產(chǎn)量和產(chǎn)率。注意不要將RNA 稀釋在 DEPC 水中檢測 OD260和OD280,否則光吸收比在 TE中測得的低 10%-15%,因為核酸光吸收跟溶液 pH相關(guān),而 DEPC 水中的DEPC高壓分解后產(chǎn)生的CO2與水反應(yīng)生成碳酸,使溶液 pH降低進而降低 RNA的光吸收。
15. RNA 純度測定:
無污染的總 RNA的OD260/OD280一般在 1.8-2.1 之間(具體數(shù)值與其堿基組成和溶液成分等多種因素有關(guān)),OD260/OD230一般在2.0-2.3 之間,如果低于或高于此范圍則分別表示樣品可能有蛋白質(zhì)或多糖的污染,但一般不影響 RT-PCR等反應(yīng)。蛋白質(zhì)污染可以通過酚/氯fǎng抽提一次然后酒精沉淀去除,DNA和多糖污染可以分別用百奧萊博的DNAScavenger和PS Scavenger去除。
疑難解答:
Q:上樣孔里的紅色熒光物一定是污染的基因組DNA嗎?
A:不是。用 TAE或TBE電泳液和非變性膠電泳 RNA時容易產(chǎn)生此現(xiàn)象,百奧萊博初步研究發(fā)現(xiàn)大部分紅色熒光物是變性不充分的單鏈RNA 通過堿基互補或通過硼酸絡(luò)合(如果使用TBE作電泳液的話)形成的復(fù)合物,加 RNase處理后,這些紅色熒光物一般會消失。為避免此現(xiàn)象,建議zuì好使用甲醛變性膠電泳。如果需要使用非變性膠,也必須在上樣前使RNA變性。使用百奧萊博優(yōu)化的上樣/變性/染色三用溶液 RNAload可以使 RNA在非變性膠上電泳時也有較好分辨率。使用非變性膠時,可以使用TAE或超快電泳液SuperBuffer-2,zuì好不要使用TBE緩沖液,因為TBE中的硼酸能與RNA的多羥基形成復(fù)合物,RNA 很難形成銳利的條帶。
Q:如何確認(rèn)和去處除污染的基因組 DNA?
A:如果懷疑有 DNA污染,可以用 RNase處理 RNA樣品,然后再電泳。如果上樣孔里的紅色熒光物不消失,則表示是基因組 DNA污染。進一步確認(rèn)可以使用 PCR擴增法。去除污染的DNA可以使用非酶的DNA 去除劑DNA Scavenger或RNase-free DNase,由于RNase-free DNase一般都有殘留的RNase污染,所以必須嚴(yán)格按照廠家提供的使用說明書進行操作。
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