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PCR實驗室的核心問題是什么?
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PCR實驗室原則上分為四個單獨的工作區(qū)域:試劑準備區(qū)、標本制備區(qū)、擴增區(qū)、產(chǎn)物分析區(qū)。為避免交叉污染,進入各個工作區(qū)域必須嚴格遵循單一方向進行,從試劑準備區(qū)→標本制備區(qū)→擴增區(qū)→產(chǎn)物分析區(qū)單向流動。
實驗室空調(diào)通風系統(tǒng)設計及壓力控制是PCR實驗室的重中之重,雖然PCR實驗室沒有嚴格的空氣潔凈度要求,但是為避免各個功能區(qū)之間交叉污染的可能性,應采用送風、全送全排的氣流組織形式,并保證各功能區(qū)的壓力梯度要求。各功能區(qū)的壓力梯度要求如下:
試劑準備區(qū)主要進行的操作為貯存試劑的制備、試劑的分裝和主反應混合液的制備。試劑和用于樣品制作的材料應直接運送至該區(qū),不得經(jīng)過其他區(qū)域。試劑原材料必須貯存在本區(qū)內(nèi),并在本區(qū)內(nèi)制備成所需的貯存試劑。
標本制備區(qū)主要進行的操作為樣本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入至擴增反應管和測定DNA的合成。本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為正壓,以避免從鄰近區(qū)進入本區(qū)的氣溶膠污染。另外,由于在加樣操作中可能會發(fā)生氣溶膠所致的污染,所以應避免在本區(qū)內(nèi)不必要的走動。
擴增區(qū),已制備的DNA模板 (來自樣本制備區(qū))的加入和主反應混合液(來自試劑制備區(qū))制備成反應混合液等也可在本區(qū)內(nèi)進行。本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為負壓,以避免氣溶膠從本區(qū)漏出。為避免氣溶膠所致的污染,應盡量減少在本區(qū)內(nèi)的不必要的走動。個別操作如加樣等應在超凈臺內(nèi)進行。
產(chǎn)物分析區(qū)主要進行的操作為擴增片段的測定。本區(qū)是主要的擴增產(chǎn)物污染來源,因此對本區(qū)的壓力梯度的要求為:相對于鄰近區(qū)域為負壓,以避免擴增產(chǎn)物從本區(qū)擴散至其它區(qū)域。
PCR實驗室的核心問題是如何避免污染,由于一旦發(fā)生污染,實驗就必須停止,直到找到污染源為止,而且實驗結(jié)果必須作廢,需重新進行實驗。所以發(fā)生污染后再圍繞實驗室來尋找污染源不但耗時而且繁瑣,浪費人力物力。PCR實驗室常見有擴增產(chǎn)物的污染;天然基因組DNA的污染;試劑的污染以及標本間的污染等。因此要避免污染,事前預防是關鍵。
專業(yè)的設計是避免污染的源頭,先應做到各個功能區(qū)域科學合理布置;各個功能區(qū)域要有明顯的標記(如醒目的門牌或不同的地面顏色等),以避免各個不同實驗區(qū)域設備物品、試劑等發(fā)生混淆。
其次應具備合理的空調(diào)通風系統(tǒng)設置,盡量采用送風、全送全排的空調(diào)系統(tǒng);嚴格的壓力梯度控制、緩沖、門開啟關閉互鎖,以確保“不串風”。
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